增值稅專用發(fā)票可在抵扣時進行抵扣，增值稅普通發(fā)票不能抵扣；增值稅專用發(fā)票開票時，需要購貨方提供的詳細資料，不需要普通發(fā)票，增值稅專用發(fā)票在使用時為無限制時間，增值稅普通發(fā)票的有效期為2個月。

以下是具體細節(jié)差異：

一、用途不同。

特種發(fā)票一般用于一般納稅人之間從事生產(chǎn)經(jīng)營增值稅的應稅項目；而普通發(fā)票可用于所有納稅人的一切經(jīng)營活動，當然也可用于一般納稅人的生產(chǎn)經(jīng)營增值稅。

第二，作用不同。

一般發(fā)票只是一種商業(yè)憑證，而專用發(fā)票既是一種商業(yè)憑證，又是一種扣稅憑證。

票面反映內容不一樣。

特殊發(fā)票不僅應包括一般發(fā)票所記載的內容，還應記錄購銷雙方的稅務登記號、地址、電話、銀行帳戶、稅款等。

四，結合不一樣。

特殊發(fā)票不能只是一般發(fā)票的聯(lián)次，更要有扣稅聯(lián)。

反映的價格不一樣。

一般發(fā)票所反映的價格是含稅價，而稅金和價格并沒有分離；專用發(fā)票反映的是不含稅價，由稅金和價格分開計算。對于增值稅、非增值稅小規(guī)模納稅人，增值稅專用發(fā)票不能辦理。因此，開出普通發(fā)票與專用發(fā)票計算增值稅是相同的，但開專用發(fā)票，買方有條件可以抵扣(例如，購貨方是一般納稅人)開普通發(fā)票、農業(yè)發(fā)票、運輸發(fā)票小規(guī)模購買稅控機外，可在規(guī)定期限內抵扣)，進項稅額可以抵扣，開普通發(fā)票、農產(chǎn)品發(fā)票、小規(guī)模購買稅控機買方都無法抵銷。